首先可以对症治疗，严重的腹泻患者，必要时可应用止泻药物，及时纠正腹泻所引起的水、电解质紊乱和酸碱平衡，对严重营养不良者应该采取营养支持，予补充氨基酸、维生素以及白蛋白等。
其次还可以针对病原菌治疗：根据各项检查结果，对病原菌采取针对性的治疗，以致缩短病程。
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