原发非结核分枝杆菌肺病有敏感药物治疗的,有手术适应证的、年龄较轻的非播散型的、未与人型结核菌或HIV等混合感染的非结核分枝杆菌肺病预后较好,如堪萨斯分枝杆菌肺病多为原发性,对多种药物敏感预后较好。
反之,继发的缺少敏感药物治疗的,没有手术适应证的、年龄较大的播散型的,与结核菌或HIV等病原微生物混合感染的,预后较差,不一定一年半准能痊愈,在CD4下降达到国家免费用药条件时,结核如果没治疗好,应该同时吃抗病毒的药,还得进行免疫重建,非结核分枝杆菌感染目前没有国家免费治疗政策
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