肠胃炎与细菌、病毒有关,常见的带菌有蔬果和食物包括熟或半熟的食物,未煮熟的鲜肉、鸡、海产、蛋、成长中的芽菜,还有葡萄球菌和沙门杆菌,来自处理食品的人员,污染的禽类、肉类及鱼类中的弯曲杆菌,还有就是大肠杆菌,这种细菌大多无害,但有几种可引起初生婴儿的急性胃肠炎。
病毒感染往往也可引致胃肠炎及肠炎,轮状病毒是最常见病原体,此外,还有腺病毒、肠病毒、手足口病毒等。
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