小儿肠胃炎的原因可能是肠道菌群感染或者饮食不洁导致的，肠道内的感染可以由细菌和病毒造成，特别是致病性大肠杆菌，是主要的致病菌。
小孩由于饮食不当，会导致急性肠胃炎这个疾病的产生，有的小孩子吃的时间比较长的不容易消化的食物，会诱发急性肠胃炎的产生。
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