首先要进行结肠镜检查。该检查是本病诊断和鉴别诊断的最重要手段之一。应作全结肠及回肠末段检查，直接观察肠粘膜变化，取活组织检查，并确定病变范围。
其次是粪便检查。粪便常规检查肉眼观常有粘液脓血，显微镜检见红细胞和脓细胞。粪便病原学检查的目的是要排除感染性结肠炎。
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