两年前做的针管治疗，现在又开始牙疼是什么

两年前一颗大牙得了虫牙，然后按医生说的杀死牙神经，做了个全烤瓷牙套。没过多久又开始牙疼，但疼了一两天就好了，就没管。现在疼的越来越频繁了，医生说发炎了，建议我把牙套拆除重新清理。然后说我有三根根管，但严重钙化，针都戳弯了都还没戳通。今天弄了一个多小时弄通了一个根管。我想问:1.现在又开始牙疼是不是以前没有清理干净？医生说里面有残水，和很多脏东西。2.是不是必须要把三个根管都打通？实在是太痛了，不想再折腾了。3.牙神经不是已经杀死了吗？为什么还会痛？通根管的时候那个针一戳下去简直痛得钻心啊。4.完全清理干净