胚胎停止发育最常见的原因是由于胚胎自身问题引起的，比如胚胎染色体的问题。胚胎停止发育的另一个原因可见于黄体功能不全，对于黄体功能不全的患者需要检查孕酮。
如果孕酮低尽早补充孕酮进行黄体支持治疗。胚胎停止发育的原因还有甲状腺功能的问题。
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