肛瘘是由肛周脓肿未经正确治疗反复发作而形成窦道，一般好发于男性小儿。肛瘘形成原因是由于婴儿肛周脓肿反复破溃，愈合在破溃，这样反复形成，一个慢性的窦道。
也可能是肛线及肠呈囊性扩张，并有分泌功能，而继发感染形成窦道。
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