怀孕40天做什么流产最好？

从你的描述来看，你的情况是早孕，因为时间短，可以做药物流产的，但是在药物流产前，需要做超声检查，确诊胎囊在宫腔内后，才可以进行治疗的。

一般来说月经错后10天左右，就可以在宫腔内发现胎囊的，如果发现了胎囊，就可以除外宫外孕的，而且怀孕时间在49天内的话，可以通过药物流产进治疗，这样就可以起到很好的效果，而且对于身体的损伤是比较小的。