常见药物：头头孢哌酮、庆大霉素、甲硝唑、新诺明、奥美拉唑及驱虫药病原治疗病毒性肠炎一般不需病原治疗，可自愈。肠毒素性细菌性肠炎一般也不应用抗菌药。
侵袭性细菌性肠炎，最好根据细菌药物敏感试验结果选用抗菌药。
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