引起小儿腹泻的原因主要有两方面，一是感染性因素，二是非感染性因素。感染性因素包括病毒感染、细菌感染、寄生虫感染。
病毒感染有轮状病毒引起的小儿秋季腹泻、诺如病毒性腹泻；细菌感染有痢疾杆菌引起的细菌性痢疾、霍乱弧菌感染引起的霍乱等。
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