甲肝病毒进入肝脏后，会引起一定程度的肝损伤。肝细胞受损后，肝功能会发生障碍，因此不能完成胆红素的正常代谢，使血中的胆红素水平增高。
血液中过多的胆红素会沉积在皮肤、黏膜和巩膜，造成皮肤发黄。由于甲肝病毒感染的自限性，这种原因引起的皮肤黄染程度较轻，且消失很快。
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