睡眠呼吸暂停综合症通常需要与中枢性睡眠呼吸暂停和肥胖低通气综合症相鉴别。肥胖低通气综合症患者有肥胖且清醒时的二氧化碳潴留。
并且可排除其他疾病引起的高碳酸血症。中枢性睡眠呼吸暂停，睡眠中反复发生呼吸暂停。发生呼吸暂停时无呼吸运动。
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