X染色体的异常一直被公认为是引起POF的主要病因，随着分子生物学的进展，在常染色体上也发现了越来越多的与POF相关的候选基因。
自20世纪50年代开始，研究者发现9%～40%的POF合并其他内分泌腺体或系统的自身免疫性疾病，如自身免疫性甲状腺炎。
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