你好，根据你所描述的情况，巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢引起的。建议能够到正规医院就诊，行腹腔镜等治疗方法进行治疗为佳。
如果巧克力囊肿并不是很大，卵巢能够正常排卵。是可以怀孕的。希望我的解答能够帮助到你。
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